47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2868 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  97.5 
 
 
240 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  87.08 
 
 
240 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  76.79 
 
 
227 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  62.18 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  51.82 
 
 
241 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  51.82 
 
 
241 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  51.14 
 
 
241 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  44.17 
 
 
240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1761  hypothetical protein  40.79 
 
 
156 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.758553  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  27.88 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  25.62 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  25.47 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2278  hypothetical protein  29.71 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0545786  normal  0.385005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  23.98 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  24.87 
 
 
346 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  26.09 
 
 
344 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  22.5 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  22.78 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  22.36 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  22.36 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  23.97 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  27.19 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  31.03 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  22.36 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  29.89 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  29.89 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  26.72 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.25 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  26.5 
 
 
300 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.33 
 
 
255 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  26.87 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  22.77 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  23.21 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  24.57 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  27.11 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  22.81 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  25.76 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  35.79 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  22.77 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  23.21 
 
 
256 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  23.21 
 
 
256 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  28.18 
 
 
244 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  23.21 
 
 
256 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  23.21 
 
 
256 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  23.21 
 
 
256 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  22.79 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>