51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0733 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  33.64 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  31.63 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  28.64 
 
 		 343 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  30.09 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 		 344 aa  88.6  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  27.36 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  25.5 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  25.13 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  27.32 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  26.07 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  26.07 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  26.07 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  25.13 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  25.13 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  23.62 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2278  hypothetical protein  26.17 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0545786  normal  0.385005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  30.33 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  22.96 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  22.84 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  24.12 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  25.22 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  23.47 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  28.69 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  27.88 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  26.7 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  27.88 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  27.88 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  20.74 
 
 		 240 aa  48.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  24.31 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  26.83 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  27.43 
 
 		 299 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  27.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  27.43 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  24.86 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  27.43 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  26.86 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  26.18 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  26.06 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  27.43 
 
 		 369 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  25.62 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  24.58 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  27.12 
 
 		 258 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>