80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0058 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  99.59 
 
 		 245 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  98.78 
 
 		 245 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  93.88 
 
 		 245 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  93.88 
 
 		 245 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  93.47 
 
 		 245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  93.06 
 
 		 245 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  76.73 
 
 		 247 aa  333  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  45.34 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  42.86 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  43.5 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  42.26 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  43.09 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  42.98 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  44.08 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  41.87 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  38.49 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  39.69 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  40.96 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  44.86 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  42.8 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  36.61 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  38.24 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  37.89 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  39.68 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  38.24 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  37.9 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  33.61 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  34.17 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  34.17 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  35 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  36.51 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  38.4 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  36.51 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  34.44 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  34.57 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  34.57 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  34.57 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  33.06 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  34.65 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  39.34 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  34.06 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.01 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  29.49 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  28.14 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  29.26 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  29.39 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  28.19 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  26.42 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  25.82 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  29.15 
 
 		 344 aa  52  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  39.29 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  27.88 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  27.54 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  29.2 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  28.76 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  26.39 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.32 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  24.9 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  26.98 
 
 		 177 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.85 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25.29 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  26.98 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  26.87 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  32.33 
 
 		 254 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>