62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2072 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  33.64 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  29.58 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  30.58 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  30.8 
 
 		 343 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  28.44 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  27.43 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 344 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  28.3 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  26.29 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  26.29 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  26.29 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  26.89 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  29.29 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  25.7 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  26.83 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  31.18 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  26.47 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  26.49 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  24.87 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  25.4 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2278  hypothetical protein  27.82 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0545786  normal  0.385005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  25.41 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  25.41 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  25.95 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  25.41 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  22.78 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  22.78 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  23.16 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  22.22 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  24.34 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  24.72 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  26.69 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  26.58 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  25.91 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  23.84 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  22.4 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  28.24 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  22.33 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1761  hypothetical protein  26.23 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.758553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  30.83 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  25 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  24.42 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  28.35 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  24.18 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  24.65 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  23.32 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  23.79 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  24.86 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  22.4 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  27.45 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  25.89 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  27.45 
 
 		 259 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  26.01 
 
 		 264 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  24.88 
 
 		 261 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>