22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0188 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0188  permease  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  56.61 
 
 
252 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  55.03 
 
 
252 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  55.03 
 
 
252 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  54.5 
 
 
252 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  55.56 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  55.56 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  55.03 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  57.89 
 
 
251 aa  191  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  54.88 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  43.75 
 
 
256 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  53.97 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  45.08 
 
 
246 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  40.74 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  34.38 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 
253 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  29.26 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  32.67 
 
 
254 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  45.28 
 
 
59 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  31.52 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  27.52 
 
 
244 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>