31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03809 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  100 
 
 		 256 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  54.42 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  47.81 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  46.49 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  46.93 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  46.05 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  46.75 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  46.75 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  47.77 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  50 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  44.92 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  43.75 
 
 		 197 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  43.1 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  40.86 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  41.95 
 
 		 177 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  41.82 
 
 		 115 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  26.7 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  27.51 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  25.11 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  26.7 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  28.11 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  28.99 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  21.59 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  39.29 
 
 		 59 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  33.7 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  21.74 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  20.83 
 
 		 344 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  22.46 
 
 		 343 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  24.12 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  24.51 
 
 		 263 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>