29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1760 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1760  permease  100 
 
 
251 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  52.8 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  51.6 
 
 
252 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  51.2 
 
 
252 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  52.59 
 
 
252 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  50.79 
 
 
251 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  50.79 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  50.4 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  57.89 
 
 
197 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  48.4 
 
 
256 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  51.6 
 
 
254 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  43.75 
 
 
246 aa  175  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  49.41 
 
 
177 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  42.69 
 
 
256 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  39.02 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  38.43 
 
 
257 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  47.83 
 
 
115 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  26.42 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  30.85 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  28.89 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  29.28 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  45 
 
 
59 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  29.36 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  29.82 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  28.25 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  28.26 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  24.26 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  29.17 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  28.12 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>