35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3148 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
240 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  47.08 
 
 
241 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  51.14 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  51.14 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  51.14 
 
 
241 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  46.25 
 
 
240 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  44.17 
 
 
240 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  43.75 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  43.44 
 
 
227 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  29.29 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1761  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.758553  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2278  hypothetical protein  29.11 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0545786  normal  0.385005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  28.7 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  26.58 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  28.51 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  23.01 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  26.11 
 
 
252 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  25.33 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  25.66 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  27.16 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  27.16 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  27.16 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  25.22 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.38 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  25.76 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  24.75 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  25.31 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  25.98 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  26.75 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  27.9 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  26.61 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  27.2 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>