61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2774 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  52.9 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  50.4 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  49.19 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  43.85 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  43.02 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  39.51 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  40.57 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  39.92 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  40.41 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  39 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  38.19 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  39.17 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  40.41 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  41.57 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  36.11 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  36.11 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  35.71 
 
 		 245 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  42.47 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  38.4 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  36.61 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  34.43 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  36.61 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  36.11 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  35.46 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  32.52 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  40.41 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  32.92 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  36.14 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  33.87 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  36.14 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  40.76 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  34.07 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.13 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  28.89 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  29.65 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  27.78 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  29.88 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  25.65 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  23.63 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.69 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  26.69 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  26.94 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  26.94 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  26.94 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  26.94 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  32.76 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>