59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2832 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  63.04 
 
 
250 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  47.62 
 
 
256 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  42.47 
 
 
259 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  37.44 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  43.09 
 
 
250 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  42.39 
 
 
257 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  45.95 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  38.2 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  41.21 
 
 
254 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  38.2 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  41.76 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  42.02 
 
 
255 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  40.61 
 
 
255 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  37.36 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  38.6 
 
 
252 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  39.67 
 
 
282 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  39.57 
 
 
254 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  38.3 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  39.04 
 
 
254 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  38.8 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  38.8 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  38.8 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  38.58 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  38.07 
 
 
245 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  38.58 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  34.25 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  38.58 
 
 
245 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  34.25 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  38.95 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  40.78 
 
 
252 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  37.3 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  36.46 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  39.38 
 
 
255 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  38.59 
 
 
251 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  44.25 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  34.39 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  37.89 
 
 
252 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  36.47 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  32.45 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.79 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  29.17 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  25.52 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  32.5 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  30.91 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  31.95 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  32.18 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  32.18 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  31.61 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  29.61 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  29.89 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  32.6 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  32.04 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  43.1 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.24 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  30.77 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  25.58 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>