78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1234 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  80.88 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  75.1 
 
 		 252 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  62.95 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  54.1 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  42.11 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  41.2 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  43.62 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  39.17 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  38.67 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  45.19 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  37.96 
 
 		 249 aa  161  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  38.33 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  41.34 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  41.06 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  40.8 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  36.86 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  38 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  37.6 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  34.17 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  35.12 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  37.6 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  37.75 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  34.58 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  35.34 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  34.82 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  36.03 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  31.98 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  31.98 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  32 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  38.27 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  31.43 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  31.43 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  32.93 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  31.43 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  32.55 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  31.95 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  27.55 
 
 		 301 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  25.81 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  26.61 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  29.29 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  26.64 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  30.61 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  28.88 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.11 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  29.87 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  22.53 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.66 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.89 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  27.86 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  30.13 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  25.35 
 
 		 344 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.41 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  30.98 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  42.62 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0249  protein of unknown function DUF81  29.79 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4666  hypothetical protein  27.16 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4773  hypothetical protein  27.16 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  23.86 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  29.26 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  24.11 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  24.11 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  24.11 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>