63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4207 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  91.37 
 
 		 276 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  81.03 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  48.24 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  45.1 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  44 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  44 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  42.91 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  45.61 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  42.86 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  44.92 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  43.57 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  43.1 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  40.76 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  41.77 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  40.76 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  41.22 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  39.36 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  40.41 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  41.1 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  44.17 
 
 		 246 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  37.13 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  37.45 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  38.24 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  38.24 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  38.24 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  37.39 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  37.39 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  37.39 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  38.36 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  37.39 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  37.98 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  38.08 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  35.77 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  40.61 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  36.95 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  36.59 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  35.68 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  35.34 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  31.05 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  31.05 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 		 272 aa  98.6  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  31.05 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  32.78 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  29.87 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  26.76 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  28.32 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.1 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  26.73 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  26.91 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  31.22 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.57 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  30.34 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  34.88 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.49 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  22.41 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  39.62 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.24 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  22.67 
 
 		 291 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  22.67 
 
 		 291 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  22.67 
 
 		 291 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>