63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3764 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  91.13 
 
 
267 aa  417  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  93.12 
 
 
267 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  91.87 
 
 
246 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  91.13 
 
 
267 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  62.66 
 
 
238 aa  299  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  63.48 
 
 
230 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  66.11 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  65.27 
 
 
241 aa  278  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  56.07 
 
 
251 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  52.17 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  57.08 
 
 
254 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  58.12 
 
 
254 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  57.69 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  55.51 
 
 
251 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  56.65 
 
 
250 aa  208  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  53.65 
 
 
250 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  53.65 
 
 
250 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  50.22 
 
 
248 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  53.95 
 
 
250 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  55.36 
 
 
254 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  54.27 
 
 
270 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  53.16 
 
 
254 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  45.38 
 
 
250 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  43.88 
 
 
261 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  45.83 
 
 
250 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  43.03 
 
 
261 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  51.25 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  47.66 
 
 
251 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  51.74 
 
 
251 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  45 
 
 
244 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  52.81 
 
 
278 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  49.59 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  43.44 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  51.8 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  43.33 
 
 
259 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  50.22 
 
 
254 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  46.25 
 
 
258 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  47.6 
 
 
256 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  51.96 
 
 
194 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  47.88 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  32.51 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  61.02 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  45.83 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  47.89 
 
 
83 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  26.61 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  29.39 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  25.96 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  32.95 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  26.94 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  28.3 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  28.3 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  28.3 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  28.3 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  27.98 
 
 
257 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  27.07 
 
 
261 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  34.78 
 
 
255 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>