64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0652 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  52.59 
 
 
256 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  63.04 
 
 
246 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  43.85 
 
 
259 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  42.45 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  41.77 
 
 
255 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  41.5 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  35.1 
 
 
249 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  40.32 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
254 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  41.2 
 
 
250 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  43.03 
 
 
276 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  42.34 
 
 
251 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  38.58 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  37.2 
 
 
252 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  35.71 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  39.52 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  37.25 
 
 
245 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  37.25 
 
 
245 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  37.25 
 
 
245 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  40.56 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  39.92 
 
 
244 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  37.89 
 
 
245 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  40.48 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
245 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  38.28 
 
 
245 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  37.89 
 
 
245 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  35.68 
 
 
245 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  36.07 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  36 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  41.13 
 
 
252 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  36.58 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  39.67 
 
 
246 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  35.32 
 
 
272 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  29.91 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  30.89 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  31 
 
 
247 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  27.89 
 
 
301 aa  92.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  30.98 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  28.97 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  31.43 
 
 
260 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  30.24 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  30.61 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  30.61 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  30.54 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.83 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  30.18 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  28.73 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  40.85 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  24.62 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  28.5 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.43 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  34.21 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  30.05 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.29 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  26.2 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  27.56 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>