53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1342 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  97.31 
 
 
260 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  65.42 
 
 
255 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  63.89 
 
 
251 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  65.08 
 
 
251 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  65.08 
 
 
251 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  64.68 
 
 
251 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  51.78 
 
 
284 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  46.96 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  48.16 
 
 
248 aa  204  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  42.79 
 
 
245 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  39.61 
 
 
251 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  40.68 
 
 
254 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  35.71 
 
 
240 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  31.09 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.89 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.96 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  29.61 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  29.61 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  29.61 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.94 
 
 
291 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  32.42 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  30.97 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  30.28 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  25.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1447  hypothetical protein  74.29 
 
 
62 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  27.08 
 
 
344 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  29.72 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  27.6 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  25.73 
 
 
243 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  29.95 
 
 
243 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  29.36 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  30.28 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  29.91 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  29.49 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  26.2 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  29.82 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  31.16 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  29.49 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  29.82 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  24.1 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  26.84 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  29.36 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  26.84 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  26.36 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.59 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  33.11 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  28.93 
 
 
237 aa  42  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>