35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6166 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  50.81 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  45.13 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  34.4 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  34.03 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  35.32 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  34.58 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  34.85 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  34.03 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  33.62 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  31.17 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  30.99 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  29.65 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  28.94 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  26.47 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  24.47 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  32.59 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  24.78 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  35.92 
 
 		 146 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  27.16 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  22.75 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  28.89 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  24.31 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  27.83 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  23.11 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  26.84 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>