117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2931 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  461  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  34.71 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  31.95 
 
 
248 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  30.54 
 
 
297 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  29.49 
 
 
291 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  29.49 
 
 
291 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  29.49 
 
 
291 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.76 
 
 
291 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  28.22 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  26.36 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  30.51 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  23.95 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  30.04 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  29.54 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  28.02 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.17 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  28.44 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  28.7 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  26.45 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.51 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2549  protein of unknown function DUF81  26.81 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.491339 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  24.78 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  24.78 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 
255 aa  62.8  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  25 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  26.75 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  30.99 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  27.8 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  24.2 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  30.16 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  26.48 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  24.69 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  27.95 
 
 
242 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  28.93 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  22.41 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  29.31 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  22.41 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  26.37 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  24.68 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  26.73 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  27.82 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  27.1 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  25.33 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  27.1 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  24.89 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  25.55 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  24.78 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  23.56 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  25.6 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  25.62 
 
 
247 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  28.14 
 
 
243 aa  52  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  26.46 
 
 
246 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  25.11 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  25.11 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  24.35 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  28.74 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  29.95 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  22.5 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  24.23 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  27.63 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  26.75 
 
 
250 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  23.53 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  25.33 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  22.01 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  23.89 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  21.34 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  32.47 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  28.1 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  24.02 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  24.78 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  24 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  24.02 
 
 
247 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
261 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  26.24 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  24.47 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1041  protein of unknown function DUF81  28.77 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0163787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  25.1 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  27.2 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  20.92 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  24.43 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  25.25 
 
 
240 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  22.17 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  23.14 
 
 
247 aa  45.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  24 
 
 
253 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>