38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1943 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0249  protein of unknown function DUF81  43.72 
 
 
254 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  42.45 
 
 
251 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  37.8 
 
 
255 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17700  protein of unknown function DUF81  43.04 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4984  protein of unknown function DUF81  41.99 
 
 
248 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3392  hypothetical protein  38.35 
 
 
243 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00810  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  32.76 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  30.96 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  30.67 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  33.94 
 
 
241 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.62 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  22.88 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  31.28 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  30.38 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  21.03 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  24.3 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  20.94 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  34.88 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  22.88 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  22.88 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  22.88 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  22.12 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  23.42 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  28.99 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  29.86 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  22.46 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  26.54 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  25.99 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  29.11 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  22.29 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24.09 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  32.54 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  26.14 
 
 
242 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  30.72 
 
 
246 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 
247 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>