38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0249 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0249  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
254 aa  473  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  43.72 
 
 
247 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  42.34 
 
 
251 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17700  protein of unknown function DUF81  42.08 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4984  protein of unknown function DUF81  45.02 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00810  protein of unknown function DUF81  35.83 
 
 
250 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3392  hypothetical protein  38.14 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.568583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  28.88 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.25 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  26.36 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  35.03 
 
 
261 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  24.12 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  29.65 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  28.86 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  25.2 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  30.84 
 
 
253 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
251 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  26.47 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  26.47 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  29.14 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  27.36 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  28.81 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  23.64 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  28.28 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  25.61 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.48 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  28.49 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  24.87 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  28.98 
 
 
246 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>