50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1919 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  52.23 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  57.89 
 
 		 261 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  49.35 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  48.26 
 
 		 235 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  38.99 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  41.05 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  37.44 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  38.5 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  31.56 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  40.17 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  37.33 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  35.5 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  31.56 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  30.22 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  31.33 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  37.1 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  46.29 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  31.76 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  31.19 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  31.33 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  30.9 
 
 		 247 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  30.9 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  37.84 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  30.04 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  30.04 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  30.04 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  29.63 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  28.94 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  29.11 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  39.01 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  30.7 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  28.82 
 
 		 244 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  30.88 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  30.22 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  34.02 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  47.52 
 
 		 174 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  31.33 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  22.32 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  34.83 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  28.42 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  21.89 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  33.14 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.96 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  26.6 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>