69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
238 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  49.35 
 
 
268 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  46.31 
 
 
240 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  41.82 
 
 
241 aa  158  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  43.38 
 
 
241 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  45.92 
 
 
261 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  45.99 
 
 
235 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  35.02 
 
 
243 aa  138  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  39.47 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  41.2 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  36.4 
 
 
247 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  35.96 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  34.8 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  35.09 
 
 
247 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  35.77 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  37.95 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  34.36 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  39.82 
 
 
236 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  35.92 
 
 
241 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  36.49 
 
 
244 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  33.2 
 
 
242 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  34.33 
 
 
246 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  41.78 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  36.02 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  33.62 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  33.62 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  32.05 
 
 
240 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  33.19 
 
 
247 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  33.61 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  32.33 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  32.74 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  34.84 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  33.47 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  34.96 
 
 
235 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  36.52 
 
 
257 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  41.03 
 
 
174 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  39.46 
 
 
235 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  35.53 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  32.1 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  30.3 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  28.51 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  28.65 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  31.82 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  31.02 
 
 
247 aa  52  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  30.21 
 
 
247 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  28.15 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  32.02 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  29.06 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  32.45 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  30.89 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  32.45 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  35.1 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  32.45 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  31.14 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  29.69 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  32.41 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  24.68 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  26.36 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  34.81 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  27.47 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  28.65 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  29.05 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17700  protein of unknown function DUF81  37.38 
 
 
246 aa  42.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157598  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  29 
 
 
253 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  27.36 
 
 
254 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>