60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0160 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  461  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  36.09 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  34.39 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  36.23 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  36.14 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  38.22 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  34.66 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.37 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  32.86 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  32.39 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  28.35 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  33.77 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  24.47 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  24.89 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  30.95 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  32.08 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  33.87 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  28.51 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  32.89 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  34.03 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  23.46 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0154  hypothetical protein  29.44 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418576  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.22 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  27.37 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.6 
 
 
291 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  23.63 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.6 
 
 
291 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.6 
 
 
291 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1857  hypothetical protein  31.25 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251618  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  31.5 
 
 
216 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  22.63 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.76 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  25.21 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  23.67 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  24.19 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  25.21 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  25.46 
 
 
247 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  30.5 
 
 
255 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  29.01 
 
 
276 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
247 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  31.39 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  30.04 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  32.65 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  28.44 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  30.49 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  22.95 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  22.95 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  28.1 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  22.95 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  25.21 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  22.86 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  31.65 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  31.65 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  32.85 
 
 
255 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  28.06 
 
 
260 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  22.54 
 
 
241 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>