54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4346 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  39.47 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  38.53 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  33.64 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  32.22 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  33.01 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  36.44 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  32.9 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  32.13 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  32.27 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  34.82 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  32.52 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  34.67 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  32.03 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  35.14 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  39.67 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  32.9 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  33.18 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  37.84 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  32.47 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.08 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  34.96 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  32.04 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  35.27 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  36.7 
 
 		 243 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  35.05 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  37.68 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  31.74 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  33 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  33.49 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  32.09 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  36.21 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.78 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  26.09 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  29.18 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.37 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  30.81 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  35.23 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  31.61 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  28.3 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  31.67 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.11 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17700  protein of unknown function DUF81  32.2 
 
 		 246 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>