72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0558 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  78.1 
 
 
247 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  76.86 
 
 
247 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  76.45 
 
 
247 aa  362  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  76.45 
 
 
247 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  77.18 
 
 
244 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  76.03 
 
 
247 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  78.1 
 
 
247 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  77.69 
 
 
247 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  77.69 
 
 
247 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  77.27 
 
 
247 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  74.9 
 
 
245 aa  329  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  74.9 
 
 
244 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  79.25 
 
 
244 aa  324  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  73.31 
 
 
246 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  70.95 
 
 
246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  43.35 
 
 
242 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  42.01 
 
 
240 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  40.89 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  40 
 
 
240 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  35.02 
 
 
238 aa  138  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  32.2 
 
 
241 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  34.22 
 
 
242 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  35.22 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  34.07 
 
 
240 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 
241 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  34.54 
 
 
261 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  31.91 
 
 
240 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  31.03 
 
 
257 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  31.67 
 
 
239 aa  99  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  31.05 
 
 
241 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  28.94 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  31.65 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  24.64 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  27.63 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  34.84 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  32.72 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  29 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  33.79 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.02 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  27.91 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  23.83 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  31.15 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  24.45 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  30.41 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.14 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.82 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.95 
 
 
260 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
263 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  24.31 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.24 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  29.88 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  32.65 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  23.58 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  24.02 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  24.45 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  24.02 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  24.02 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.44 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  24.02 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  23.5 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  23.5 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  23.5 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  27.63 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1041  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 
241 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0163787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>