66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3844 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  65.11 
 
 		 236 aa  284  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  54.47 
 
 		 235 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  38.86 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  36.32 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  37.61 
 
 		 242 aa  121  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  39.46 
 
 		 268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  41.26 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  36.51 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  35.59 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  31.51 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  33.49 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  32.72 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  38.42 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  29.57 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  40.24 
 
 		 261 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  31.31 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  31.51 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  35.03 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  32.52 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  27.43 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  28.21 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  28.21 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  27.69 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  28.72 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  31.35 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  28.12 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  27.36 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  28.72 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  28.72 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  28.21 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  27.18 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  36.77 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  26.7 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  29.63 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  33.78 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  29.65 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  28.02 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  28.71 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  39.51 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  22.98 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  31.52 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  24.18 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.55 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  24.18 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  24.18 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  25.68 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.58 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  21.21 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  36.67 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  21.21 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  29.95 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  36.67 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  29.21 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  31.02 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  28.99 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  36.67 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  28.71 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  28.93 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  28.71 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  28.22 
 
 		 245 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>