110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4296 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  100 
 
 
291 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  87.29 
 
 
291 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  29.83 
 
 
240 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  28.77 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.7 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  29.49 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  28.02 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.61 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  28.09 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  28.09 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  27.69 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  24.66 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29.24 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  28.99 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  25.81 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  28.5 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  26.09 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  29.82 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  23.42 
 
 
247 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  28.4 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  28.44 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  24.63 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  26.61 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  23.24 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  25.21 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  24.24 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  27.83 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  25.56 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 
248 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  27.39 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  25.91 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  25.99 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.81 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 
272 aa  52.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  23.5 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  24.1 
 
 
2798 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  27.07 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  27.23 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  24.15 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  25.45 
 
 
251 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  27.23 
 
 
251 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  25.55 
 
 
250 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  24.87 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  29.22 
 
 
245 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  27.85 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  27.85 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  23.21 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  27.85 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  20.18 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  22.42 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  22.27 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  24.31 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  26.79 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  23.77 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  28.28 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  29.82 
 
 
254 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  22.9 
 
 
247 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  25.28 
 
 
236 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  23.68 
 
 
245 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  24.66 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  29.17 
 
 
254 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 
243 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  25.94 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  29.8 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  25.89 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  25.23 
 
 
240 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  26.36 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  30.16 
 
 
254 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  24.78 
 
 
250 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  30.71 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.39 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  26.36 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  20.42 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  28.28 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  22.43 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  22.43 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  26.24 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  20.83 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  24.14 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  26.15 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  26.24 
 
 
240 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  22.43 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  23.2 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  22.97 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  26.43 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  21.97 
 
 
247 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>