66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0620 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  84.43 
 
 		 244 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  79.1 
 
 		 247 aa  384  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  79.51 
 
 		 247 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  83.2 
 
 		 247 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  79.1 
 
 		 247 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  79.1 
 
 		 247 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  78.28 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  82.79 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  82.38 
 
 		 247 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  82.79 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  79.25 
 
 		 243 aa  364  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  76.17 
 
 		 246 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  78.83 
 
 		 244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  72.88 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  75.83 
 
 		 246 aa  314  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  45.49 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  41.63 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  42.08 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  40.69 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  36.4 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  37.44 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  35.65 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  34.19 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  32.31 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  31.74 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  36.05 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  34.01 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  32.05 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  31.78 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  33.03 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  30.43 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  33.06 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  36.13 
 
 		 174 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  32.2 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  27.68 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  26.55 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.71 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  27.47 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  29.69 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  34.72 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  25.64 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  31.65 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  24.45 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.91 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  25.97 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  30.73 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  25.55 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25.2 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1041  protein of unknown function DUF81  44.68 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0163787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  31.73 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0407  radical SAM family protein  23.72 
 
 		 435 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  25.32 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  24.11 
 
 		 255 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  31.87 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1702  hypothetical protein  29.21 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0934945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>