31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3833 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 267 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0154  hypothetical protein  35.59 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  29.74 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29.29 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  31.36 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  39.62 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  35.47 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  34.09 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  28.96 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  26.36 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.75 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1702  hypothetical protein  34.04 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0934945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  25.83 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  34.05 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  28.05 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  30.56 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  30.56 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  31.3 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  30.56 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  29.83 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  29.44 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  32.24 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  30.94 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  34.6 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  27.35 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  27.83 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  25.68 
 
 		 255 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>