42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0831 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
253 aa  480  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  71.49 
 
 
250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  67.07 
 
 
248 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  72.41 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  66.27 
 
 
251 aa  306  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  68.15 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  66.12 
 
 
249 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  65.25 
 
 
249 aa  295  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  65.68 
 
 
249 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  63.16 
 
 
270 aa  292  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  68.97 
 
 
247 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  42.31 
 
 
243 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  38.06 
 
 
247 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  47.83 
 
 
146 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  33.2 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  32.63 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  30.3 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  28.51 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  25.83 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  23.85 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  23.21 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  21.86 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  24.05 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  26.05 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  26.2 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  20.73 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  21.14 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  25.68 
 
 
246 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  24.43 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  22.86 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  26.67 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  26.67 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  26.67 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  27.55 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  21.79 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  26.58 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>