51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2202 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  65.65 
 
 
248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  56.14 
 
 
284 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  48.18 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  48.16 
 
 
260 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  46.15 
 
 
255 aa  201  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  48.31 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  48.31 
 
 
251 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  47.03 
 
 
251 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  47.03 
 
 
251 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  40.2 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  38.96 
 
 
254 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  37.32 
 
 
245 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  33.49 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.2 
 
 
252 aa  72  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  31.08 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  31.08 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  29.65 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  27.76 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.68 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  25.11 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  26.58 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  25.45 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.61 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  24.06 
 
 
343 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  22.01 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  22.96 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  22.94 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  25.91 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  26.13 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  26.09 
 
 
237 aa  45.4  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  26.13 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  26.13 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  22.51 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  24.55 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  25.45 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.02 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  24.31 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  25.93 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  25.45 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  21.05 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  24.64 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  24.43 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  29.68 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  32 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  22.5 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  25.49 
 
 
240 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  24.58 
 
 
239 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>