43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4196 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  92.03 
 
 
251 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  92.03 
 
 
251 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  91.63 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  78 
 
 
255 aa  351  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  63.89 
 
 
260 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  63.89 
 
 
260 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  54.98 
 
 
284 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  48.1 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  48.79 
 
 
248 aa  204  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  41.59 
 
 
245 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  40.93 
 
 
251 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  39.48 
 
 
254 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  34.6 
 
 
240 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  29.54 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  27.48 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1447  hypothetical protein  82.86 
 
 
62 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  26.75 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  26.23 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.93 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  26.92 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  32.11 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  26.92 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  28.5 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  27.83 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  25.62 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.43 
 
 
291 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.89 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.89 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.89 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  25.89 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  26.32 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  24.6 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  25.38 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  24.46 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.87 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  26.24 
 
 
240 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>