25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13510 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
237 aa  462  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  39.46 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  30.34 
 
 
291 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  28.94 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  28.94 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  28.94 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  28.94 
 
 
284 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  27.78 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29.15 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  26.06 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.57 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  22.41 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  26.06 
 
 
245 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  25.31 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  22.13 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  27.81 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  26.37 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  25.96 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  26.64 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  22.63 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  31.53 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  31.53 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  28.93 
 
 
260 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  28.3 
 
 
252 aa  41.6  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>