60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2216 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  60.99 
 
 
270 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  62.34 
 
 
278 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  51.87 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  52.77 
 
 
254 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  54.08 
 
 
254 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  51.53 
 
 
251 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  53.22 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  51.95 
 
 
249 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  51.95 
 
 
249 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  51.95 
 
 
249 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  45.11 
 
 
238 aa  178  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  52.38 
 
 
246 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  46.7 
 
 
230 aa  174  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  52.16 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  47.84 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  47.84 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  51.52 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  52.16 
 
 
267 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  48.09 
 
 
254 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  50.43 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  51.35 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  46.52 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  42.86 
 
 
251 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
250 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  50.44 
 
 
250 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  56.09 
 
 
256 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  48.67 
 
 
250 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  48.88 
 
 
250 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  49.11 
 
 
250 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  42.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  46.32 
 
 
249 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  41.74 
 
 
244 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  42.02 
 
 
261 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  44.55 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  42.5 
 
 
259 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.08 
 
 
250 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  45.08 
 
 
251 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  49.55 
 
 
254 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  49.36 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  41.63 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  45.81 
 
 
194 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  45.81 
 
 
256 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  30.54 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  75 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  44.29 
 
 
123 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  30.59 
 
 
309 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  27.27 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  17.45 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  28.33 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  47.69 
 
 
83 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  26.55 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  28.39 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  20.9 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  25.51 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  28.21 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  26.04 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>