21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0179 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  39.48 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.86 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  25.71 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  25.85 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  26.92 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  26.41 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  22.67 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  25.97 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  27.01 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  22.94 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  23.53 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  25.78 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  22.57 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  25.44 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  25.44 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  25.83 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  27.04 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>