40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1027 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  95.62 
 
 		 251 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  95.22 
 
 		 251 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  91.63 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  75.6 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  64.68 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  64.68 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  53.71 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  48.31 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  50.65 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  42.2 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  34.6 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  38.43 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  28.18 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  28.94 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  29.11 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  25.78 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1447  hypothetical protein  80 
 
 		 62 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  24.44 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.6 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  28.23 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  26.84 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  26.84 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  26.79 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  26.79 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  26.79 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  27.49 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  29.21 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  26.34 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  26.84 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.41 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  25.3 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  26.87 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  27.64 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>