61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2505 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  54.08 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  44.02 
 
 
255 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  42.62 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  43.24 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  42.62 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  41.39 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  40.82 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  42.79 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  38.07 
 
 
240 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  39.36 
 
 
248 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  39.23 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  38.28 
 
 
284 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 
252 aa  92  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  32.04 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  32.04 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  35.32 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  26.27 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  28.3 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  28.3 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  28.3 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  29.54 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  29.67 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  28.28 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  24.89 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  24.79 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  28.91 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  28.89 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.56 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.42 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  30.5 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  28.44 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  22.07 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  25.54 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  29.52 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  22.82 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  23.23 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  28.98 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  22.22 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  34.83 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  25.55 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  31.28 
 
 
247 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  29.3 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  25.71 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  26.32 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  27.94 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  26.61 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  27.12 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  28.06 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  27.96 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  24.87 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  29.02 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  27.14 
 
 
252 aa  42  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  31.9 
 
 
250 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  22.84 
 
 
263 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  25.53 
 
 
248 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  24.88 
 
 
247 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>