104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5325 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  100 
 
 
291 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  87.29 
 
 
291 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  87.29 
 
 
291 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  87.29 
 
 
291 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.81 
 
 
240 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  30.59 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.96 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  29.34 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.17 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  30.73 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  26.03 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.54 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29 
 
 
240 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  28.94 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  28.94 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  26.07 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  26.07 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  28.5 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  25.35 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  23.43 
 
 
247 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  25.24 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  30.32 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  25.55 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  24.14 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  26.61 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  24.34 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  25.21 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.08 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  24.18 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  28.21 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  25.11 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  27.83 
 
 
248 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  26.43 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  27.07 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 
253 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  21.93 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  26.17 
 
 
244 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  26.84 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  23.74 
 
 
247 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  25.71 
 
 
243 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  25.55 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 
248 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  26.29 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  26.29 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  27.9 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  25.11 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  23.81 
 
 
247 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 
261 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  24.3 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  23.81 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  24.58 
 
 
272 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  23.81 
 
 
247 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  22.86 
 
 
247 aa  48.9  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  26.19 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  25.76 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  26.34 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  24 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  25.43 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  24.72 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  22.54 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  25.55 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  26.8 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  25.45 
 
 
249 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  26.75 
 
 
242 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
241 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  24.37 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  23.61 
 
 
2798 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  22.37 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
243 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  23.33 
 
 
247 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  29.58 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  28.31 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  28.81 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  27.16 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  28.66 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  27.16 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  26.11 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  30.43 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  27.16 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  24.22 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  23.37 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  22.86 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  24.27 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  22.86 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  20.59 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  24.23 
 
 
248 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  28.31 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  22.52 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  21.81 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  29.17 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  29.37 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  24.64 
 
 
240 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  29.41 
 
 
174 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  25.93 
 
 
250 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  29.54 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>