42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1069 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  99.6 
 
 		 251 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  95.22 
 
 		 251 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  92.03 
 
 		 251 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  76.4 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  65.08 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  65.08 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  53.68 
 
 		 284 aa  214  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  46.84 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  47.81 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  43.12 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  41.2 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  38.63 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  35.18 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  29.15 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  30.64 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  30.51 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.67 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  26.22 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1447  hypothetical protein  80 
 
 		 62 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  26.83 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  28.71 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.23 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  26.64 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.23 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.23 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  26.72 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  24.44 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  27.12 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  27.12 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  27.63 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.44 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  31.53 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  27.64 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  25.88 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  27.03 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  31 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  25.55 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.57 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  26.32 
 
 		 256 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>