63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2380 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  38.07 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  38.38 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  35.34 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  35.93 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  38.03 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  38.03 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  35.56 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  32.76 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  35.11 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  35.11 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  34.78 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  32.77 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  33.48 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  36.16 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.94 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.9 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.04 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.04 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.04 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  30.25 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  32.65 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  26.87 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  34.32 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  33.13 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  30.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  28.94 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  31.49 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  27.57 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  27.8 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.86 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  30.09 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  29.22 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  30.89 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  28.4 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25.86 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  27.16 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  28.81 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  28.81 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  27.09 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  28.33 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  32.04 
 
 		 346 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  27.98 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  27.98 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  28 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  29.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  27.57 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.7 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1041  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0163787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  28.74 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.38 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  28.11 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  29.06 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  29.85 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  25.1 
 
 		 259 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2549  protein of unknown function DUF81  23.83 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.491339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>