44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1317 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
263 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  92.4 
 
 
263 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  49.78 
 
 
258 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  37.84 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1857  hypothetical protein  35.86 
 
 
250 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251618  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  30.32 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29.9 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  29.74 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  29.76 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.88 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  26.29 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  25.96 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  26.35 
 
 
244 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  24.49 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.97 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  24.49 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  24.49 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  29.26 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 
248 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  31.69 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  24.43 
 
 
240 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  30.48 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  24.02 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  22.84 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  28.06 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  27.01 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  27.39 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  25.34 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  28.7 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  26.02 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1702  hypothetical protein  27.9 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0934945  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  30.48 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>