47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1229 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 263 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  92.4 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  51.98 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  39.91 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1857  hypothetical protein  34.91 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251618  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  29.09 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  31.94 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  29.35 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.97 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.44 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  25.81 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  26.61 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  27.57 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  27.55 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29.91 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  26.83 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  24.87 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  31.3 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  26.79 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  30.13 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25.64 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  27.63 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  27.63 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0154  hypothetical protein  26.36 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  28.97 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  28.97 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.56 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  28.97 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  30.48 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  26.05 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  27.06 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  29.93 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  29.96 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  21.89 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  27.62 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>