25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0695 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  53 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  34.26 
 
 
262 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  33.48 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  35.68 
 
 
251 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  38.1 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  32.23 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.06 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  29.86 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  35.03 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  28.71 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  29.58 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  27.66 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  26.43 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  24.02 
 
 
263 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  21.09 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  30.69 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  28.68 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  28.63 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  28.3 
 
 
247 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  25.66 
 
 
242 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  28.4 
 
 
247 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>