46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1149 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
297 aa  554  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
247 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  31.54 
 
 
240 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  32.13 
 
 
247 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.45 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  27.76 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  26.81 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  19.69 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  28.24 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.85 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  27.84 
 
 
253 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  27.84 
 
 
253 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  27.08 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  27.59 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  29.15 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  31.49 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  27.64 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  27.2 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.8 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.8 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.8 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  30.74 
 
 
242 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  27.59 
 
 
247 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  27.59 
 
 
247 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  27.59 
 
 
247 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  27.98 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  26.95 
 
 
240 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 
252 aa  49.7  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  26.98 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  27.2 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  25.52 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  25.51 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  29.37 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  31.36 
 
 
244 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  26.82 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  26.82 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  26.44 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  26.38 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
238 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  27.69 
 
 
244 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  29.62 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  30.72 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  27.83 
 
 
261 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>