61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3553 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  75.1 
 
 		 247 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  73.88 
 
 		 247 aa  361  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  72.24 
 
 		 247 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  76.73 
 
 		 247 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  71.84 
 
 		 247 aa  353  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  76.33 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  76.33 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  71.43 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  72.95 
 
 		 244 aa  351  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  75.92 
 
 		 247 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  70.95 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  75.21 
 
 		 244 aa  324  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  69.96 
 
 		 245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  75.83 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  65.98 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  44.59 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  42.98 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  40.68 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  38.94 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  37.84 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  36.68 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  35.19 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.92 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  33.18 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  32.6 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  33.19 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  33.49 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  35.93 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  31.76 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  34.25 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  30.7 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  32.49 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  33.19 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  34.84 
 
 		 174 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  25.23 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  26.87 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  29.57 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.2 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  30.43 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  36.41 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  28.29 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29.05 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  28.74 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  28 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  27.6 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  28.95 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.11 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0709  protein of unknown function DUF81  23.87 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0154  hypothetical protein  25.11 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  31 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  21.57 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  30.15 
 
 		 258 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  25.23 
 
 		 251 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>