57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0676 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  65.11 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  51.27 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  39.82 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  38.74 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  36.02 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  37.33 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  40.27 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  33.9 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  35.4 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  34.23 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  36.82 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  30.59 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  30.77 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  29.24 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.87 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  36.7 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  30.14 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  26.11 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  28.44 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  26.99 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  25.66 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  38.22 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  25.22 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  32.43 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  26.32 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  25.22 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  25.22 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  27.63 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  26.32 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  25.22 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  24.78 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  32.09 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  24.78 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  26.11 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  29.15 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  35.95 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  26.15 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  26.55 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  26.87 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.85 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  28.43 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  28.18 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  31.25 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  27.76 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.21 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.21 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  29.06 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  24.34 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  24.58 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  29.06 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  28.21 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  26.2 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  30.13 
 
 		 260 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>