72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2275 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  434  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  50.64 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  48.26 
 
 
268 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  47.26 
 
 
238 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  48.97 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  36.91 
 
 
247 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  37.61 
 
 
247 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  37.17 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  37.17 
 
 
247 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  35.34 
 
 
242 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  35.84 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  35.34 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  35.62 
 
 
243 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  36.48 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  35.96 
 
 
245 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  36.48 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  36.05 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  36.05 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  33.93 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 
241 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  37.79 
 
 
244 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  31.76 
 
 
242 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  35.05 
 
 
240 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  34.96 
 
 
251 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  34.05 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  35.93 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  36.73 
 
 
242 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  36.05 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  34.8 
 
 
235 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  35.93 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  37.93 
 
 
239 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  34.04 
 
 
243 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  39.87 
 
 
174 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  32.89 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  34.4 
 
 
235 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  31.91 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  30.91 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  30.91 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  25.11 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  34.12 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  23.81 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  31.22 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  22.94 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  21.65 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  32.03 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  24.64 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  23.6 
 
 
272 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  23.48 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  33.68 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  26.78 
 
 
240 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24.86 
 
 
248 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  27.68 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  22.65 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  24.09 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  31.76 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  26.47 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  22.65 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  22.22 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  22.22 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  24.39 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  31.01 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  29.58 
 
 
343 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  28.47 
 
 
344 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  21.79 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  23.5 
 
 
252 aa  42  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  27.12 
 
 
253 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>