43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2292 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  465  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  43.11 
 
 
239 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  31.86 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  37.85 
 
 
251 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 
238 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  29.36 
 
 
241 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  41.08 
 
 
261 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  37.5 
 
 
241 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  31.58 
 
 
268 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  33.76 
 
 
242 aa  98.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  30.14 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  29.66 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  30.33 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  37.19 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  31.68 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  29.61 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  30.69 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  31.19 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  31.19 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  30.54 
 
 
240 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  30.2 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  33.05 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  28.71 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  35.09 
 
 
243 aa  82  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 
241 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  29.41 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  31.02 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  30.05 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  32.69 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  25.51 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  30.15 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  32.46 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  29.7 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  29.7 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  29.7 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  29.7 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  31.58 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  28.96 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  32.88 
 
 
174 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  41.18 
 
 
235 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  24.75 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>