66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0614 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  474  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  91.09 
 
 
247 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  91.5 
 
 
247 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  91.09 
 
 
247 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  91.09 
 
 
247 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  91.09 
 
 
247 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  90.69 
 
 
247 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  90.69 
 
 
247 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  91.09 
 
 
247 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  78.28 
 
 
244 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  78.1 
 
 
243 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  79.51 
 
 
244 aa  337  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  76.35 
 
 
244 aa  337  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  75.1 
 
 
246 aa  328  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  70.95 
 
 
246 aa  321  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  70.83 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  41.63 
 
 
242 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  43.44 
 
 
240 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  40.26 
 
 
240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  40.35 
 
 
240 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  37.78 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  32.76 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  33.77 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  34.36 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  33.48 
 
 
240 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  34.6 
 
 
243 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  36.91 
 
 
235 aa  121  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  33.18 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  32.07 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  32.9 
 
 
251 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
261 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  31.33 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  32.38 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  32.58 
 
 
241 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  33.05 
 
 
239 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  31.36 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  34.19 
 
 
174 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  26.34 
 
 
235 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  26.32 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  26.18 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.05 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  27.71 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  32.56 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  30.68 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  30.73 
 
 
260 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  24.79 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  26.82 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  30.28 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.33 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.33 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  21.72 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.4 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  26.67 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  29.03 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  28.71 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  22.37 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1041  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0163787  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  28.48 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  28.06 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  23.87 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  23.87 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>