71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000279 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  90.76 
 
 
240 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  75.22 
 
 
240 aa  322  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  61.64 
 
 
242 aa  272  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  53.3 
 
 
242 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  41.63 
 
 
244 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  42.02 
 
 
245 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  41.23 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  40.35 
 
 
247 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  41.23 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  41.23 
 
 
247 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  40.35 
 
 
247 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  40 
 
 
243 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  40.79 
 
 
247 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  40.35 
 
 
247 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  40.35 
 
 
247 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  39.91 
 
 
247 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  40.37 
 
 
244 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  39.21 
 
 
246 aa  148  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  40.09 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  40.69 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  36.04 
 
 
242 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  39.21 
 
 
243 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  33.99 
 
 
241 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  37.62 
 
 
241 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  32.33 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  31.56 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  33.01 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  37.2 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  36.49 
 
 
239 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  30.59 
 
 
236 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  31.98 
 
 
240 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  31.05 
 
 
241 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  38.41 
 
 
235 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.13 
 
 
261 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  29.41 
 
 
235 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  30.3 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  35 
 
 
174 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  30.5 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  29.86 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  33.18 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  31.64 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  31.64 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  30.41 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  30.23 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  31.4 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  29.65 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  32.48 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  30.81 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  30.81 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  30.81 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  30.23 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  31.52 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  27.86 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  28.34 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  30.97 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.81 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  23.48 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  31.34 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  23.66 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  29.41 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  25.71 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  34.94 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.41 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.41 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2549  protein of unknown function DUF81  27.35 
 
 
248 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.491339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  23.93 
 
 
247 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  26.34 
 
 
262 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>