49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0416 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  67.36 
 
 
243 aa  287  8e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  39.92 
 
 
242 aa  161  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  37.97 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  38.89 
 
 
240 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  41.13 
 
 
240 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  36.91 
 
 
244 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  35.98 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  37.44 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  36.17 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  36.17 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  36.17 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  37.45 
 
 
244 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  34.89 
 
 
247 aa  134  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  35.74 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  38.43 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  35.32 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  36.49 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  34.89 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  40.5 
 
 
268 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  34.04 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  34.47 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  34.47 
 
 
247 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  36.52 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  35.75 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  35.56 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  38.14 
 
 
241 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  36 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  35.44 
 
 
257 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  39.11 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  34.03 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  34.93 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  32.64 
 
 
249 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  36.97 
 
 
235 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  39.67 
 
 
251 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  35.29 
 
 
243 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  39.51 
 
 
261 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  41.67 
 
 
174 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  40.38 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 
297 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.5 
 
 
272 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  32.32 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.96 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.67 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  34.66 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  22.47 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>